Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms