Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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