Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usp48Q3V0C5 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp48Q3V0C5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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