Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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