Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf224Q3UIW8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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