Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nkx6-3Q3UHX8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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Nkx6-3Q3UHX8 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Nkx6-3Q3UHX8 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Nkx6-3Q3UHX8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Nkx6-3Q3UHX8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Nkx6-3Q3UHX8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Nkx6-3Q3UHX8 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Nkx6-3Q3UHX8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Nkx6-3Q3UHX8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Nkx6-3Q3UHX8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Nkx6-3Q3UHX8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Nkx6-3Q3UHX8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Nkx6-3Q3UHX8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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