Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gtpbp6Q3U6U5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gtpbp6Q3U6U5 Olfr170-203ENSMUST00000218837 1008 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 4931417E11Rik-201ENSMUST00000070163 1095 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr170-201ENSMUST00000078603 1008 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gtpbp6Q3U6U5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gtpbp6Q3U6U5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Gtpbp6Q3U6U5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Gtpbp6Q3U6U5 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Gtpbp6Q3U6U5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms