Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calr4Q3TQS0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms