Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Tmem104Q3TB48 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Tmem104Q3TB48 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Tmem104Q3TB48 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Tmem104Q3TB48 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Tmem104Q3TB48 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Tmem104Q3TB48 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Tmem104Q3TB48 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Tmem104Q3TB48 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem104Q3TB48 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms