Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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