Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Samd12Q0VE29 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms