Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab42Q0PD08 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms