Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms