Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 AC163038.2-201ENSMUST00000224851 650 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Olfr53-201ENSMUST00000084456 1328 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 D730045A05Rik-201ENSMUST00000159260 1269 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Mtcp1-202ENSMUST00000114081 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Slirp-202ENSMUST00000160488 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Lsm5-201ENSMUST00000170382 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Clpsl2-201ENSMUST00000025061 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Olfr1057-201ENSMUST00000099892 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms