Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MestQ07646 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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MestQ07646 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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MestQ07646 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MestQ07646 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
MestQ07646 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
MestQ07646 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MestQ07646 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MestQ07646 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MestQ07646 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MestQ07646 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MestQ07646 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MestQ07646 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
MestQ07646 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
MestQ07646 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MestQ07646 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MestQ07646 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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