Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm3532-201ENSMUST00000181880 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Vmn1r-ps110-201ENSMUST00000117530 1094 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 3110056K07Rik-201ENSMUST00000127129 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms