Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms