Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms