Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ascl1Q02067 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms