Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms