Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms