Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RhodP97348 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RhodP97348 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms