Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SbdsP70122 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbdsP70122 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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