Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms