Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps3P62908 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms