Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
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Lmo4P61969 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Lmo4P61969 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Lmo4P61969 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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