Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms