Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Atp5bP56480 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atp5bP56480 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atp5bP56480 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atp5bP56480 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atp5bP56480 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atp5bP56480 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atp5bP56480 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atp5bP56480 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atp5bP56480 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atp5bP56480 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atp5bP56480 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atp5bP56480 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Atp5bP56480 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atp5bP56480 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atp5bP56480 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Atp5bP56480 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms