Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Abcd3P55096 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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