Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PctpP53808 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms