Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

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Length 930 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
XpcP51612 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
XpcP51612 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
XpcP51612 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
XpcP51612 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
XpcP51612 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XpcP51612 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XpcP51612 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XpcP51612 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XpcP51612 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XpcP51612 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XpcP51612 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XpcP51612 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XpcP51612 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XpcP51612 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
XpcP51612 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
XpcP51612 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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XpcP51612 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XpcP51612 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XpcP51612 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XpcP51612 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XpcP51612 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XpcP51612 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XpcP51612 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XpcP51612 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XpcP51612 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XpcP51612 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XpcP51612 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XpcP51612 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XpcP51612 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XpcP51612 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XpcP51612 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XpcP51612 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XpcP51612 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XpcP51612 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XpcP51612 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XpcP51612 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XpcP51612 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XpcP51612 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XpcP51612 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XpcP51612 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XpcP51612 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
XpcP51612 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XpcP51612 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
XpcP51612 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
XpcP51612 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
XpcP51612 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XpcP51612 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XpcP51612 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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