Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
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Defa6P50704 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Defa6P50704 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa6P50704 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms