Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TspoP50637 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TspoP50637 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms