Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
FmodP50608 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
FmodP50608 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
FmodP50608 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
FmodP50608 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
FmodP50608 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
FmodP50608 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
FmodP50608 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
FmodP50608 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
FmodP50608 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
FmodP50608 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
FmodP50608 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
FmodP50608 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
FmodP50608 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
FmodP50608 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
FmodP50608 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms