Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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