Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PtpreP49446 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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PtpreP49446 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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PtpreP49446 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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PtpreP49446 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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PtpreP49446 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtpreP49446 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtpreP49446 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtpreP49446 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtpreP49446 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms