Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Gm14481-201ENSMUST00000117178 629 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rplp1P47955 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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