Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk2P38575 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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