Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TpoP35419 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TpoP35419 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TpoP35419 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TpoP35419 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TpoP35419 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TpoP35419 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TpoP35419 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TpoP35419 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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TpoP35419 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TpoP35419 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TpoP35419 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TpoP35419 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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TpoP35419 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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TpoP35419 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TpoP35419 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TpoP35419 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TpoP35419 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TpoP35419 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TpoP35419 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TpoP35419 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TpoP35419 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TpoP35419 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TpoP35419 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TpoP35419 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TpoP35419 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TpoP35419 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TpoP35419 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TpoP35419 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TpoP35419 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TpoP35419 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TpoP35419 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms