Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms