Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psmb9P28076 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms