Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms