Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TP20293 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TP20293 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TP20293 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TP20293 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TP20293 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TP20293 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TP20293 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TP20293 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TP20293 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TP20293 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TP20293 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TP20293 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TP20293 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TP20293 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TP20293 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TP20293 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TP20293 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TP20293 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TP20293 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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TP20293 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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TP20293 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TP20293 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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TP20293 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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TP20293 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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TP20293 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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TP20293 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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TP20293 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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TP20293 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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TP20293 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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TP20293 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TP20293 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TP20293 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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TP20293 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TP20293 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TP20293 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TP20293 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TP20293 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TP20293 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TP20293 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TP20293 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TP20293 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TP20293 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TP20293 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TP20293 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TP20293 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TP20293 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TP20293 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TP20293 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TP20293 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TP20293 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TP20293 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TP20293 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TP20293 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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