Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P20040 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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