Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Csn1s1P19228 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms