Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18533 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18533 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18533 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18533 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18533 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18533 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18533 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18533 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18533 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18533 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18533 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18533 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18533 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms