Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
PcnaP17918 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PcnaP17918 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms