Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Sidt2-202ENSMUST00000114573 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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