Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gabra6P16305 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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