Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RhoP15409 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RhoP15409 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RhoP15409 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RhoP15409 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RhoP15409 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RhoP15409 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RhoP15409 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RhoP15409 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RhoP15409 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RhoP15409 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RhoP15409 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RhoP15409 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RhoP15409 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RhoP15409 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RhoP15409 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms